ATA 单证出口报关的流程如下：
单证准备：收到签发的 ATA 单证册后，检查各栏目填写是否正确，绿色封面和货物清单是否加盖出证机构印章，持证人或其授权人需在绿色封面右下方 “持证人签字处” 签字和 / 或盖章。若报关代理有变更，需准备中文授权委托书（进出中国口岸时）。
填写出口凭证：使用 ATA 单证册黄色出口凭证进行出口申报，在凭证 D 栏填入运输方式，E 栏填入包装情况，F 栏填入从中国出境货物的项号，持证人代表在凭证右下方签字。
提交申报：将单证册交给出境地海关。单证册第一次出境时，必须由出境地海关关员在绿色封面左下方签注盖章，此时单证册才正式生效。
海关签注：出境地海关关员在黄色出口存根第 1 栏填入所有出境货物的项号，在存根和凭证上分别签注盖章，并撕下凭证留存。
特殊情况处理：如果货物在国内需要联运，在最终出境地口岸海关办理出口申报手续。
ATA 单证册项下的暂准出口货物属于国家限制出口或需缴纳出口税的货物，由中国国际商会统一向海关总署提供总担保。