股东已经实缴出资通常需要进行以下程序和确认：
股东出资凭证：股东在实缴出资时，应提供相应的出资凭证，例如银行转账凭证、出资确认书、出资通知书等。这些凭证可以作为证据来证明股东已经实际缴纳出资。
公司财务记录：公司应当按照法律规定建立并保持完整的财务记录。公司的财务记录应包括股东的实缴出资情况，包括具体的出资金额、时间和方式等。通过公司的财务记录，可以确认股东是否已经实际缴纳出资。
财务报表和审计：公司应定期编制财务报表，并由独立注册会计师进行审计。财务报表和审计报告中会披露股东的实缴出资情况，其中包括资本公积、实收资本等项目。股东已经实缴的出资应在财务报表和审计报告中得到确认。
公告和登记机构记录：根据相关法律规定，公司应及时公告股东实际出资情况，并在登记机构（如商事登记机关）进行备案。公告和登记机构的记录可以作为证据来证明股东的实缴出资情况。
股东会议记录：公司应定期召开股东会议，会议记录中应记录股东的实缴出资情况，包括出资金额、时间和方式等。股东会议记录可以作为证据来证明股东已经实际缴纳出资。
请注意，以上程序和确认方法是一般情况下的做法，具体要求可能会因不同国家或地区的法律和监管要求而有所不同。为确保准确性和合规性，建议在股东实缴出资的程序和确认过程中咨询专业的法律机构、注册会计师或相关监管机构。需要做出评估报告或相关问题咨询请找 好评评估。