三类医疗器械NMPA注册的办理流程如下：
准备申请材料，包括《医疗器械经营企业许可申请表》、资格证明、营业执照或企业名称预先核准证明文件复印件、质量管理人的资格证明、售后服务人员的资格证明等。
向所在地设区的市级人民政府食品药品监督管理部门提交申请，并提交上述材料。
工作人员受理资料，并于30个工作日内进行审查，必要时组织核查。
对符合规定条件的，准予许可并发给医疗器械经营许可证；对不符合规定条件的，不予许可并书面说明理由。
需要注意的是，办理三类医疗器械NMPA注册的具体流程可能因地区和政策的不同而有所差异，建议在办理前先咨询相关部门或机构，了解具体的申请流程和要求。
