在丰台区办理食品经营许可证，需要准备以下申请资料：
企业营业执照、食品卫生许可证和食品经营许可证申请表。
经营场所租赁合同和食品生产、加工、经营流程图。
商户还需要注意以下几点：
审批周期：食品经营许可证的审批周期较长，通常需要60个工作日左右，提前准备申请资料是很必要的。
许可条件：在提交申请前，商户应该了解在丰台区开展食品经营的相关许可条件，包括有关经营场所的要求、原材料采购、食品生产、加工、储存、运输、销售等方面要求，以及关于食品质量、安全、卫生方面的要求等。了解许可条件有助于商户尽早做好准备和规避申请过程中的疑难问题。
审批流程：商户应该了解相关的审批流程，了解审批流程有助于商户快速排除疑难问题。商户可以通过咨询、网络咨询、现场咨询等方式了解审批流程，并且还可以通过相关网站查询、下载申请表格等，方便自己正常开展食品经营。
耐心等待审批结果：商户提交申请后，需要耐心等待审批结果。在这个过程中，商户可以通过咨询或网上查询等方式了解审批进度。
对于食品经营许可证办理过程中的疑难问题，商户可以通过以下几种方式解决：
咨询人士：商户可以咨询的律师或相关机构，了解食品经营许可证的申请流程和注意事项，以及如何解决疑难问题。
寻求协助：商户可以向当地的工商部门或相关机构寻求协助，了解有关食品经营许可证的具体要求和流程，以及如何准备申请资料等。
查询相关法律法规：商户可以通过查询相关的法律法规和政策文件，了解食品经营许可证的申请条件和要求，以及如何符合相关标准等。
在办理食品经营许可证的过程中，商户需要提前了解相关要求和流程，准备好申请资料，并且耐心等待审批结果。对于遇到的疑难问题，商户可以通过咨询人士、寻求协助或查询相关法律法规等方式解决。