有限责任公司也要缴纳特许经营税，但其计算方式与S公司不同。有限责任公司的税率不是基于净收入的统一百分比，而是基于总收入等级的统一美元数额。
总收入在25万美元到499,999美元之间的，要缴纳900美元的税。总收入在50万至9999美元之间的，缴纳2500美元的税。毛收入在100万到499,999美元之间的，支付6000美元的税款。毛收入在500万美元以上的，缴纳11,790美元的税款。
对于总收入低于25万美元的企业，适用800美元的醉低特许经营税。有限责任公司的净收入转给企业主，企业主也仍要支付个人所得税。