经导管人工肺动脉瓣膜系统注册证的办理需要遵循相关法规和规定，以下是一般办理流程：
了解相关法规和标准：需要了解与经导管人工肺动脉瓣膜系统相关的法规和标准，包括医疗器械注册管理条例、医疗器械注册技术审查指导原则等。
准备申请材料：根据相关法规和规定，准备经导管人工肺动脉瓣膜系统的注册申请材料，包括产品技术要求、制造过程质量控制、临床试验报告等。
提交申请：将申请材料提交给国家药品监督管理部门或指定的医疗器械注册受理机构。
技术评审：国家药品监督管理部门会对申请材料进行技术评审，包括对产品的安全性、有效性、质量可控性等方面进行评估。
临床试验：对于需要证明其安全性和有效性的医疗器械，需要进行临床试验。经导管人工肺动脉瓣膜系统可能需要进行相应的临床试验以验证其性能和安全性。
审核与批准：经过技术评审和临床试验后，国家药品监督管理部门会对申请进行审核。一旦审核通过，会颁发医疗器械注册证，允许产品在市场上销售。