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天气变化、极端天气事件以及气象灾害等对呼吸道传染病、肠道传染病，以及各种自然疫源性具有影响，气候和环境的变化还对某些新传染病的产生和某些传染病消亡具有影响等，流行病学专家也很关注气象灾害与人类健康之间的关系，气象灾害对人类健康造成最直接的危害是引起伤亡，间接危害是导致生态环境的改变，自然疫源地的迁徙、扩大，从而引起各种传染病的暴发流行。
洪涝灾害时易发生的传染病主要有消化道传染病(霍乱、甲肝、戊肝、痢疾、伤寒、感染性腹泻、肠炎等)，呼吸道传染病(流脑、麻疹、流感、感冒等)，自然疫源性(鼠疫、血吸虫病、钩体病、出血热等)，虫媒传染病(乙脑、等)，(湿疹、皮肤真菌感染等)，红眼病等。
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在完成短时预警分析后，即完成预警分析图以及SHP文件，存目录：/气象产品/日期/短时预警产品/；